Erik Højsgaard studerede komposition hos Per Nørgård på Det Jyske Musikkonservatorium og afsluttede studiet med diplomeksamen i 1978. Han studerede herefter hørelære på Det Kgl. Danske Musikkonservatorium og afsluttede studiet med musikpædagogisk eksamen.
Siden 1982 har han undervist i hørelære på Det Kgl. Danske Musikkonservatorium, fra 1988 som docent og siden 2002 som professor.
I 2003-2004 var Erik Højsgaard Ålborg Symfoniorkesters huskomponist samt lærer i komposition ved Nordjysk Musikkonservatorium.
Han har modtaget flere priser, bl.a. Carl Nielsen og Anne Marie Carl-Nielsens Hæderspris i 1993, Statens Kunstfonds treårige stipendium i 1979 og Dansk Komponistforenings Legat i 1992.
Erik Højsgaards produktion omfatter bl.a. 2 symfonier, en cellokoncert og en klaverkoncert samt operaen Don Juan vender hjem fra krigen, som i en revideret version uropførtes i Wien i 2006. Til Malko dirigentkonkurrencen i 1995 komponerede han Fragment for kammerorkester. Han har desuden komponeret kammermusik (bl.a. to strygekvartetter og en række landskabsbilleder, herunder Paysage blême, som blev uropført i London af det engelske ensemble Capricorn) samt værker for soloinstrumenter, bl.a. C’est la mer mêlée au soleil for guitar og Épreuve for accordeon.
Læs mere om Paysage blême her
Hans værker er blevet opført over det meste af verden, og han har været repræsenteret på flere internationale festivaler: ISCM Verdensmusikdage, Salzburg Festspillene, Nordiske Musikdage, NUMUS, Festival Internazionale di Musica Roma, MusikSommerBerlin, Cantiere Internazionale d'Arte Montepulciano, Copenhagen Summer Festival, Aarhus Festuge o.a.