Carl Erik Kühl tog diplomeksamen i musikteori og –historie ved Det Jyske Musikkonservatorium 1971 og har en cand.mag. i musikvidenskab og filosofi fra Aarhus Universitet 1973. Han har studeret komposition hos Per Nørgård og Pelle Gudmundsen-Holmgreen.
Til daglig er Carl Erik Kühl docent i musikteori ved Vestjysk Musikkonservatorium og hørelære ved Det Jyske Musikkonservatorium.
Værkerne omfatter sange, kammermusik, korværker og orkesterværker.
Carl Erik Kühl har i de senere år fortrinsvis arbejdet med musikfilosofi, især fænomenologiske og ontologiske problemstillinger. Han var i 1997-2000 og 2002-03 frikøbt fra undervisning med støtte fra hhv. Statens Humanistiske Forskningsråd og Kulturministeriet for at skrive afhandlingen "The Structures of Musical Temporality".
